勞動部所謂的「到職日結算」，舉例來說，甲勞工是在某年10月1日到職，其年度終結日為每年的9月30日。因此勞工特休假結算日可能都不一樣。
新制規定，對於符合特休年資的勞工，雇主須告知勞工特休假天數。勞動部官員說，勞工符合特休年資，最好能馬上告知，勞動部將明訂應於一定期限內要通知勞工；結算時，勞工有多少特休假未休完、折算成多少工資，也要在一定期限內通知勞工。官員說，原則上將以一個月為期限。未來將會明訂在勞基法施行細則中，近期則將先以函釋方式實施。
舊制係以企業年度結算特休假，舉例來說，甲勞工是2014年5月1日到職，隔年2015年1月1日仍未滿一年，企業不會給他特休假，必須等到2016年的1月1日，才開始有七天特休假。也就是說，該名勞工須等一年八個月後才有特休假；在曆年制下，甲勞工七天特休假須在2016年1月1日至2016年12月31日休完。
勞基法新制不僅增加資淺員工特休假，只要工作滿半年，就可享有三天特休假，且勞動部強烈建議，企業應以勞工到職日結算。
舉例來說，乙勞工為2016年2月1日到職，於2016年12月30日雖已工作近滿11個月，但因未滿一年，依舊制是無法享有特休假。但新制在2016年1月1日起實施，乙勞工工作超過半年，可享有三天特休假，但應於2017年1月1日至2017年1月31日間請休，若未休完，雇主應折發工資。
乙勞工若於2017年2月1日起，年資滿一年，因此自2017年2月1日至2018年1月31日間，可另排休七天特休假，到期未休完，折算工資。
勞動部認為，採周年制結算，可避免衍生勞資爭議。舉例來說，依新制，丙勞工到職日為2017年1月2日，一直工作到7月2日，年資滿半年，就享有三天特休，使用期限是7月2日到明年1月2日，若未休完，應折算成工資；若雇主維持曆年制，提早於今年底結算未休完特休，易衍生勞資爭議。
勞動部官員解釋，並非反對企業採曆年制結算特休假，過去特休係由勞資雙方協商排定，但勞基法修正後，改由勞工排定，因此，勞工的年度終結日還沒有到時，雇主無法依曆年制來結清。
104資訊科技人資長鍾文雄認為，特休假由曆年制改成周年制是正確的方向，因為曆年制在年終結算時會出現有小數點的特休假，易引發爭議，改成周年制就無此爭議。
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